Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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