Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 KCS1YDR017C 3153 nt2.79□□□□□ -1.96
MSB4Q12317 PAN2YGL094C 3348 nt2.78□□□□□ -1.97
MSB4Q12317 UBR1YGR184C 5853 nt2.78□□□□□ -1.97
MSB4Q12317 GYP5YPL249C 2685 nt2.76□□□□□ -1.97
MSB4Q12317 YAR009CYAR009C 3591 nt2.75□□□□□ -1.97
MSB4Q12317 EST2YLR318W 2655 nt2.75□□□□□ -1.97
MSB4Q12317 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt2.75□□□□□ -1.97
MSB4Q12317 IRE1YHR079C 3348 nt2.75□□□□□ -1.97
MSB4Q12317 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.74□□□□□ -1.97
MSB4Q12317 INO80YGL150C 4470 nt2.73□□□□□ -1.97
MSB4Q12317 UTP22YGR090W 3714 nt2.73□□□□□ -1.97
MSB4Q12317 snR69snR69 101 nt2.73□□□□□ -1.97
MSB4Q12317 RDS3YPR094W 324 nt2.72□□□□□ -1.97
MSB4Q12317 TFC3YAL001C 3483 nt2.71□□□□□ -1.98
MSB4Q12317 SIP4YJL089W 2490 nt2.7□□□□□ -1.98
MSB4Q12317 HIR3YJR140C 4947 nt2.7□□□□□ -1.98
MSB4Q12317 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.7□□□□□ -1.98
MSB4Q12317 NUT1YGL151W 3399 nt2.69□□□□□ -1.98
MSB4Q12317 SYH1YPL105C 2550 nt2.69□□□□□ -1.98
MSB4Q12317 SPF1YEL031W 3648 nt2.68□□□□□ -1.98
MSB4Q12317 IRA2YOL081W 9240 nt2.67□□□□□ -1.98
MSB4Q12317 YLR419WYLR419W 4308 nt2.66□□□□□ -1.98
MSB4Q12317 PSD2YGR170W 3417 nt2.65□□□□□ -1.99
MSB4Q12317 TUS1YLR425W 3924 nt2.65□□□□□ -1.99
MSB4Q12317 STH1YIL126W 4080 nt2.65□□□□□ -1.99
MSB4Q12317 BPH1YCR032W 6504 nt2.65□□□□□ -1.99
MSB4Q12317 GIP3YPL137C 3831 nt2.64□□□□□ -1.99
MSB4Q12317 DNF1YER166W 4716 nt2.63□□□□□ -1.99
MSB4Q12317 PET309YLR067C 2898 nt2.62□□□□□ -1.99
MSB4Q12317 snR14snR14 160 nt2.62□□□□□ -1.99
MSB4Q12317 TRA1YHR099W 11235 nt2.62□□□□□ -1.99
MSB4Q12317 CSE1YGL238W 2883 nt2.62□□□□□ -1.99
MSB4Q12317 KOG1YHR186C 4674 nt2.62□□□□□ -1.99
MSB4Q12317 RTT101YJL047C 2529 nt2.61□□□□□ -1.99
MSB4Q12317 RAD50YNL250W 3939 nt2.6□□□□□ -1.99
MSB4Q12317 ROM2YLR371W 4071 nt2.59□□□□□ -1.99
MSB4Q12317 SXM1YDR395W 2835 nt2.59□□□□□ -1.99
MSB4Q12317 VPS13YLL040C 9435 nt2.59□□□□□ -2
MSB4Q12317 BUL2YML111W 2763 nt2.57□□□□□ -2
MSB4Q12317 SEC16YPL085W 6588 nt2.56□□□□□ -2
MSB4Q12317 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt2.55□□□□□ -2
MSB4Q12317 STO1YMR125W 2586 nt2.55□□□□□ -2
MSB4Q12317 UTP21YLR409C 2820 nt2.54□□□□□ -2
MSB4Q12317 SSD1YDR293C 3753 nt2.54□□□□□ -2
MSB4Q12317 GEA2YEL022W 4380 nt2.54□□□□□ -2
MSB4Q12317 RAV1YJR033C 4074 nt2.54□□□□□ -2
MSB4Q12317 PRP16YKR086W 3216 nt2.53□□□□□ -2
MSB4Q12317 NST1YNL091W 3723 nt2.53□□□□□ -2.01
MSB4Q12317 IRC20YLR247C 4671 nt2.52□□□□□ -2.01
MSB4Q12317 BNI1YNL271C 5862 nt2.52□□□□□ -2.01
MSB4Q12317 PEP1YBL017C 4740 nt2.51□□□□□ -2.01
MSB4Q12317 YOL098CYOL098C 3114 nt2.51□□□□□ -2.01
MSB4Q12317 snR40snR40 97 nt2.51□□□□□ -2.01
MSB4Q12317 ULP2YIL031W 3105 nt2.51□□□□□ -2.01
MSB4Q12317 SPC110YDR356W 2835 nt2.5□□□□□ -2.01
MSB4Q12317 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt2.49□□□□□ -2.01
MSB4Q12317 FAB1YFR019W 6837 nt2.49□□□□□ -2.01
MSB4Q12317 MSH6YDR097C 3729 nt2.47□□□□□ -2.01
MSB4Q12317 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt2.46□□□□□ -2.02
MSB4Q12317 PAU12YGR294W 363 nt2.46□□□□□ -2.02
MSB4Q12317 MYO4YAL029C 4416 nt2.45□□□□□ -2.02
MSB4Q12317 HUG1YML058W-A 207 nt2.43□□□□□ -2.02
MSB4Q12317 DGR1YNL130C-A 147 nt2.43□□□□□ -2.02
MSB4Q12317 SEC31YDL195W 3822 nt2.42□□□□□ -2.02
MSB4Q12317 YSP1YHR155W 3687 nt2.42□□□□□ -2.02
MSB4Q12317 SEC8YPR055W 3198 nt2.42□□□□□ -2.02
MSB4Q12317 KAP122YGL016W 3246 nt2.42□□□□□ -2.02
MSB4Q12317 UBR2YLR024C 5619 nt2.42□□□□□ -2.02
MSB4Q12317 SPP41YDR464W 4308 nt2.41□□□□□ -2.02
MSB4Q12317 SMC4YLR086W 4257 nt2.4□□□□□ -2.02
MSB4Q12317 MSH3YCR092C 3057 nt2.38□□□□□ -2.03
MSB4Q12317 TDA9YML081W 3756 nt2.38□□□□□ -2.03
MSB4Q12317 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt2.37□□□□□ -2.03
MSB4Q12317 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt2.36□□□□□ -2.03
MSB4Q12317 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt2.36□□□□□ -2.03
MSB4Q12317 TOR2YKL203C 7425 nt2.36□□□□□ -2.03
MSB4Q12317 NUP192YJL039C 5052 nt2.36□□□□□ -2.03
MSB4Q12317 UBP2YOR124C 3819 nt2.35□□□□□ -2.03
MSB4Q12317 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.35□□□□□ -2.03
MSB4Q12317 YLR422WYLR422W 5799 nt2.34□□□□□ -2.03
MSB4Q12317 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt2.34□□□□□ -2.03
MSB4Q12317 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.32□□□□□ -2.04
MSB4Q12317 YMR045CYMR045C 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
MSB4Q12317 SEC3YER008C 4011 nt2.3□□□□□ -2.04
MSB4Q12317 CSF1YLR087C 8877 nt2.3□□□□□ -2.04
MSB4Q12317 FYV8YGR196C 2454 nt2.27□□□□□ -2.05
MSB4Q12317 ATG9YDL149W 2994 nt2.27□□□□□ -2.05
MSB4Q12317 HER1YOR227W 3741 nt2.27□□□□□ -2.05
MSB4Q12317 MSN5YDR335W 3675 nt2.27□□□□□ -2.05
MSB4Q12317 APL3YBL037W 3078 nt2.26□□□□□ -2.05
MSB4Q12317 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt2.24□□□□□ -2.05
MSB4Q12317 FKS1YLR342W 5631 nt2.24□□□□□ -2.05
MSB4Q12317 YER090C-AYER090C-A 90 nt2.23□□□□□ -2.05
MSB4Q12317 MYO1YHR023W 5787 nt2.22□□□□□ -2.05
MSB4Q12317 USO1YDL058W 5373 nt2.19□□□□□ -2.06
MSB4Q12317 NEO1YIL048W 3456 nt2.18□□□□□ -2.06
MSB4Q12317 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.17□□□□□ -2.06
MSB4Q12317 YCS4YLR272C 3531 nt2.17□□□□□ -2.06
MSB4Q12317 YOR093CYOR093C 4947 nt2.17□□□□□ -2.06
MSB4Q12317 CAT8YMR280C 4302 nt2.17□□□□□ -2.06
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