Protein–RNA interactions for Protein: P78358

CTAG1A, Cancer/testis antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAG1AP78358 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTAG1AP78358 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTAG1AP78358 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms