Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms