Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2HP62256 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms