Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
ITGA8P53708 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA8P53708 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms