Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP1P23763 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms