Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA1P14867 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms