Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHK2Q9NRA0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms