Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD2

MRPL9, 39S ribosomal protein L9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL9Q9BYD2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL9Q9BYD2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL9Q9BYD2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms