Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SS18Q15532 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SS18Q15532 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SS18Q15532 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SS18Q15532 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SS18Q15532 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SS18Q15532 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SS18Q15532 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SS18Q15532 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SS18Q15532 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms