Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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