Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1SQ13698 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
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