Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 HCG18-240ENST00000454269 2430 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.791e-8■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.885e-8■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.031e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 ITFG1-211ENST00000568047 2636 ntTSL 57.86□□□□□ -1.156e-14■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 LARP1B-209ENST00000508819 1891 ntTSL 57.76□□□□□ -1.171e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.222e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.231e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.251e-8■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 ITFG1-210ENST00000567957 924 ntTSL 27.1□□□□□ -1.276e-14■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.311e-8■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 ITFG1-202ENST00000537184 1422 ntTSL 26.13□□□□□ -1.436e-14■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 ITFG1-203ENST00000542691 1464 ntTSL 25.51□□□□□ -1.536e-14■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.571e-8■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 ITFG1-208ENST00000565262 584 ntTSL 34.34□□□□□ -1.716e-14■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 TUBA1A-202ENST00000301071 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 NME4-210ENST00000468031 1861 ntTSL 220.81■□□□□ 0.922e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 NDUFA2-202ENST00000502960 721 ntTSL 222.59■■□□□ 1.219e-12■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 VEZF1-201ENST00000258963 3948 ntTSL 1 (best)6.57□□□□□ -1.361e-6■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 AHSP-202ENST00000564707 213 ntTSL 36.74□□□□□ -1.339e-8■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.782e-7■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.432e-7■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 MRPS7-207ENST00000584678 692 ntTSL 513.96□□□□□ -0.172e-7■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 MRPS7-205ENST00000581993 731 ntTSL 213.26□□□□□ -0.292e-7■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 RPS5-203ENST00000596314 718 ntTSL 518.2■□□□□ 0.56e-21■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 INTS1-206ENST00000493446 675 ntTSL 315.32■□□□□ 0.043e-9■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.723e-6■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.593e-6■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.593e-6■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.323e-6■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 METRN-201ENST00000219542 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 230.97■■■□□ 2.551e-6■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.941e-6■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 NOSIP-208ENST00000598550 771 ntTSL 518.37■□□□□ 0.531e-18■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.536e-17■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 PDAP1-204ENST00000496335 302 ntTSL 317.38■□□□□ 0.376e-17■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.962e-9■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.622e-9■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.082e-9■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 SERPINH1-208ENST00000526638 719 ntTSL 214.29□□□□□ -0.122e-9■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.222e-9■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 NDUFA2-203ENST00000510680 576 ntTSL 216.06■□□□□ 0.163e-11■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 VARS2-209ENST00000477288 6054 ntTSL 220.44■□□□□ 0.861e-8■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 POLR2E-205ENST00000586817 2441 ntTSL 224.91■■□□□ 1.581e-11■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 POLR2E-207ENST00000590060 1052 ntTSL 521.85■■□□□ 1.091e-11■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 POLR2E-209ENST00000591767 1214 ntTSL 221■□□□□ 0.951e-11■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 POLR2E-201ENST00000215587 1286 ntTSL 319.07■□□□□ 0.641e-11■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 POLR2E-206ENST00000589737 1105 ntTSL 218.57■□□□□ 0.561e-11■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.21e-11■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.21e-11■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.091e-11■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.73e-16■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.663e-16■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 R3HDM4-204ENST00000589428 1704 ntTSL 325■■□□□ 1.593e-16■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 POLE-217ENST00000541627 2105 ntTSL 219.6■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.92e-6■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.222e-6■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.434e-7■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 PPP1R12C-207ENST00000591938 1262 ntTSL 520.7■□□□□ 0.94e-7■■■■□ 22.7
PABPC4Q13310 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.282e-7■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 MYL6-208ENST00000547703 675 ntTSL 514.88□□□□□ -0.032e-20■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 RPS10-201ENST00000326199 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.392e-7■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.482e-7■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-7■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.235e-9■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 23e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 AKAP8L-203ENST00000594594 2251 ntTSL 524.77■■□□□ 1.563e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.073e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 AKAP8L-220ENST00000609519 2113 ntTSL 221.69■■□□□ 1.063e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 AKAP8L-202ENST00000593845 2749 ntTSL 219.87■□□□□ 0.773e-8■■■■□ 22.6
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PABPC4Q13310 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.736e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.726e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.686e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.396e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.376e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.046e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.886e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.636e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.466e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.366e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.276e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 IRF3-219ENST00000597636 2874 ntTSL 516.69■□□□□ 0.266e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.086e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.863e-6■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.513e-6■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.22e-8■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 EHD1-209ENST00000484846 3469 ntTSL 214.48□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.726e-7■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.456e-7■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.256e-7■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.176e-7■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 ATXN2-203ENST00000389154 1794 ntTSL 55.67□□□□□ -1.56e-7■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 LMNB2-205ENST00000532465 769 ntTSL 322.53■■□□□ 1.26e-9■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.626e-9■■■■□ 22.6
PABPC4Q13310 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.621e-9■■■■□ 22.5
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