Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXLNAP40222 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TXLNAP40222 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TXLNAP40222 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TXLNAP40222 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TXLNAP40222 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms