Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM3P06753 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM3P06753 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPM3P06753 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPM3P06753 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPM3P06753 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM3P06753 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM3P06753 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM3P06753 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM3P06753 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM3P06753 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM3P06753 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM3P06753 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM3P06753 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM3P06753 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM3P06753 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM3P06753 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM3P06753 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM3P06753 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms