Protein–RNA interactions for Protein: P01737

T-cell receptor alpha chain V region PY14, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01737 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01737 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01737 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01737 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01737 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms