Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GLI3P10071 HAUS6-201ENST00000380496 3756 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
GLI3P10071 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GLI3P10071 CU633906.2-205ENST00000624847 1468 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
GLI3P10071 LINC01427-204ENST00000635299 1978 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
GLI3P10071 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
GLI3P10071 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GLI3P10071 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GLI3P10071 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GLI3P10071 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
GLI3P10071 DCTN4-203ENST00000447998 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GLI3P10071 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GLI3P10071 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GLI3P10071 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
GLI3P10071 SEC16A-206ENST00000431893 6465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 ZNF611-219ENST00000602162 3299 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AL133467.3-203ENST00000461160 3574 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 NPM1P51-201ENST00000443470 744 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 PHACTR1-201ENST00000332995 5332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AL355103.1-201ENST00000557246 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 ZNF587-201ENST00000339656 6882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 ZNF333-201ENST00000292530 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 IL31RA-205ENST00000396836 2426 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 SLC25A16-207ENST00000609923 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 DCLK3-201ENST00000416516 5344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 ESR1-207ENST00000440973 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 PRDM1-201ENST00000369089 4675 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 ITIH5-202ENST00000397146 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 SCAF11-202ENST00000369367 7543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GLI3P10071 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 PIGR-201ENST00000356495 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 C1S-205ENST00000406697 3076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 EPHB2-201ENST00000374627 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 C21orf140-201ENST00000410005 756 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 OPRM1-205ENST00000414028 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GLI3P10071 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 487.2 ms