Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.742e-7■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 LRRC75A-AS1-227ENST00000583400 712 ntTSL 410.31□□□□□ -0.762e-7■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 LRRC75A-AS1-223ENST00000581361 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.772e-7■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 LRRC75A-AS1-222ENST00000580770 572 ntTSL 410.12□□□□□ -0.792e-7■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-7■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC8.13□□□□□ -1.112e-7■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 LINC01088-209ENST00000512130 525 ntTSL 37.24□□□□□ -1.252e-7■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 LINC01088-206ENST00000510667 534 ntTSL 37.14□□□□□ -1.272e-7■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.332e-7■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.382e-7■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 FCGR2C-210ENST00000508651 542 ntTSL 46.12□□□□□ -1.432e-7■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 LINC01088-211ENST00000515597 664 ntTSL 1 (best)5.69□□□□□ -1.52e-7■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 LINC01088-210ENST00000513153 695 ntTSL 35.46□□□□□ -1.542e-7■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 LARP1-204ENST00000518297 2630 ntTSL 522.17■■□□□ 1.145e-11■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.285e-11■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 SON-207ENST00000436227 5269 ntAPPRIS P1 TSL 59.26□□□□□ -0.935e-8■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.56e-10■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 BDH1-211ENST00000468710 609 ntTSL 222.42■■□□□ 1.186e-10■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 BDH1-208ENST00000445160 539 ntTSL 521.39■■□□□ 1.016e-10■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 BDH1-205ENST00000432819 955 ntTSL 520.36■□□□□ 0.856e-10■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 BDH1-209ENST00000446746 868 ntTSL 320.36■□□□□ 0.856e-10■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 BDH1-216ENST00000492681 544 ntTSL 520.27■□□□□ 0.846e-10■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 BDH1-212ENST00000476764 680 ntTSL 1 (best)16.07■□□□□ 0.166e-10■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.146e-10■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 TRIM56-204ENST00000487252 735 ntTSL 311.92□□□□□ -0.55e-7■■□□□ 11.9
SLTMQ9NWH9 ESRRA-206ENST00000539594 747 ntTSL 329.14■■■□□ 2.263e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.183e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.743e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.013e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 KCNH2-204ENST00000461280 2430 ntTSL 1 (best)20.81■□□□□ 0.923e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.863e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.713e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 KCNH2-205ENST00000473610 2782 ntTSL 219.41■□□□□ 0.73e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 KCNH2-206ENST00000532957 3374 ntTSL 219.1■□□□□ 0.653e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.043e-7■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.058e-7■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.375e-7■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.16e-9■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 TIMM23B-204ENST00000483296 1156 ntTSL 217.43■□□□□ 0.382e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 AC136475.3-201ENST00000533924 309 ntTSL 517.3■□□□□ 0.365e-7■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 MGAT3-203ENST00000429402 569 ntTSL 417.09■□□□□ 0.336e-9■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.085e-7■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 ERICH1-207ENST00000522893 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.14□□□□□ -0.156e-9■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 MGAT3-202ENST00000418314 552 ntTSL 412.73□□□□□ -0.376e-9■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 TIMM23B-203ENST00000478381 2623 ntTSL 212.54□□□□□ -0.42e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 TIMM23B-202ENST00000451577 1152 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.412e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.452e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 ASPSCR1-218ENST00000583744 539 ntTSL 415.94■□□□□ 0.141e-9■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 ASPSCR1-206ENST00000578361 590 ntTSL 215.44■□□□□ 0.061e-9■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.673e-8■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.443e-8■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 BRD2-213ENST00000495733 3404 ntTSL 216.18■□□□□ 0.183e-8■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 BRD2-206ENST00000456339 887 ntTSL 415.51■□□□□ 0.073e-8■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 BRD2-212ENST00000482914 4834 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.073e-8■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 ASPSCR1-210ENST00000581608 2387 ntTSL 222.04■■□□□ 1.123e-7■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)14.68□□□□□ -0.061e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 214.41□□□□□ -0.11e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.121e-6■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.89e-8■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 423.7■■□□□ 1.389e-8■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.129e-8■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.759e-8■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 AKAP17A-203ENST00000474361 3232 ntTSL 1 (best)19.72■□□□□ 0.759e-8■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.133e-8■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 WDR6-219ENST00000498023 626 ntTSL 215□□□□□ -0.019e-8■■□□□ 11.8
SLTMQ9NWH9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.139e-8■■□□□ 11.7
SLTMQ9NWH9 GATS-204ENST00000435519 1306 ntTSL 229.55■■■□□ 2.328e-7■■□□□ 11.7
SLTMQ9NWH9 GATS-202ENST00000414739 2007 ntTSL 1 (best)26.85■■□□□ 1.898e-7■■□□□ 11.7
SLTMQ9NWH9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.648e-7■■□□□ 11.7
SLTMQ9NWH9 GATS-211ENST00000543273 2840 ntTSL 1 (best)24■■□□□ 1.438e-7■■□□□ 11.7
SLTMQ9NWH9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.968e-7■■□□□ 11.7
SLTMQ9NWH9 GATS-201ENST00000328453 3526 ntTSL 1 (best)19■□□□□ 0.638e-7■■□□□ 11.7
SLTMQ9NWH9 GATS-206ENST00000437485 443 ntTSL 510.95□□□□□ -0.668e-7■■□□□ 11.7
SLTMQ9NWH9 GATS-207ENST00000440058 554 ntTSL 210.77□□□□□ -0.698e-7■■□□□ 11.7
SLTMQ9NWH9 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.275e-10■■□□□ 11.7
SLTMQ9NWH9 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.843e-6■■□□□ 11.7
SLTMQ9NWH9 ARHGEF2-217ENST00000497907 764 ntTSL 320.07■□□□□ 0.88e-8■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 ARHGEF2-216ENST00000495070 571 ntTSL 416.99■□□□□ 0.318e-8■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.058e-8■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.088e-8■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 ARHGEF2-213ENST00000476273 668 ntTSL 314.37□□□□□ -0.118e-8■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.298e-8■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 ARHGEF2-202ENST00000313695 4080 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.48e-8■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 ARHGEF2-211ENST00000471589 892 ntTSL 511.96□□□□□ -0.498e-8■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 ARHGEF2-207ENST00000465079 693 ntTSL 211.82□□□□□ -0.528e-8■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 ARHGEF2-214ENST00000477754 883 ntTSL 56.64□□□□□ -1.358e-8■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 CERS4-202ENST00000557925 2401 ntTSL 516.41■□□□□ 0.226e-11■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.314e-7■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.194e-7■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 LDLR-201ENST00000252444 5337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.4□□□□□ -0.14e-7■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.154e-7■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.24e-7■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 LDLR-205ENST00000557933 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.314e-7■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 LDLR-208ENST00000558518 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.494e-7■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.722e-6■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.062e-6■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.082e-6■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.061e-6■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.623e-6■■□□□ 11.6
SLTMQ9NWH9 EPS8L2-216ENST00000530118 561 ntTSL 317.34■□□□□ 0.373e-6■■□□□ 11.6
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