Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP62CLQ9H1M0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms