Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DPCDQ9BVM2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms