Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms