Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms