Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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