Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PMS2P11Q13670 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PMS2P11Q13670 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PMS2P11Q13670 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PMS2P11Q13670 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PMS2P11Q13670 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PMS2P11Q13670 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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