Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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