Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 FAM126A-202ENST00000409923 3130 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.832e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 MSI2-207ENST00000579205 500 ntTSL 413.93□□□□□ -0.181e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 SPG21-214ENST00000561088 560 ntTSL 412.28□□□□□ -0.446e-8■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 CKAP5-203ENST00000525248 698 ntTSL 39.33□□□□□ -0.926e-7■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 CNOT8-220ENST00000522139 566 ntTSL 36.43□□□□□ -1.386e-7■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 GPATCH2L-205ENST00000554375 1791 ntTSL 516.82■□□□□ 0.283e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.213e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.323e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.383e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 GPATCH2L-210ENST00000556675 771 ntTSL 310.69□□□□□ -0.73e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 GPATCH2L-208ENST00000556372 539 ntTSL 37.32□□□□□ -1.243e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.43e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.643e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 NADSYN1-215ENST00000529840 820 ntTSL 512.83□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 NADSYN1-207ENST00000526039 769 ntTSL 512.23□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 NADSYN1-219ENST00000531236 3429 ntTSL 211□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 NADSYN1-204ENST00000525200 3616 ntTSL 29.11□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 DENND1A-206ENST00000473039 4800 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 DENND1A-204ENST00000394215 1380 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 ZNF562-203ENST00000585350 577 ntTSL 515.52■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 ZNF562-208ENST00000590155 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.093e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 ZNF562-207ENST00000589542 491 ntTSL 37.56□□□□□ -1.23e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.343e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 ZNF562-206ENST00000588653 585 ntTSL 26.52□□□□□ -1.373e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 ZNF562-204ENST00000585688 1475 ntTSL 25.38□□□□□ -1.553e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.653e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.753e-6■■■■□ 23.2
TARDBPQ13148 AURKA-204ENST00000395907 1902 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.062e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 TEX264-206ENST00000419358 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.09□□□□□ -0.153e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.943e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 RELT-206ENST00000545687 586 ntTSL 422.67■■□□□ 1.228e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 RELT-205ENST00000544075 744 ntTSL 321.96■■□□□ 1.118e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.688e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.098e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 ITGB1-214ENST00000488427 861 ntTSL 1 (best)5.55□□□□□ -1.529e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.891e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 PVT1-201ENST00000504719 754 ntTSL 225.43■■□□□ 1.661e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.571e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.851e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.781e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 CCDC43-204ENST00000588687 721 ntTSL 218.98■□□□□ 0.631e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 SLC7A1-202ENST00000450494 547 ntTSL 217.38■□□□□ 0.371e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.341e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 AP002990.1-201ENST00000526409 1954 ntTSL 516.5■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 CAPZB-208ENST00000482808 660 ntTSL 215.99■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 STK24-206ENST00000481288 656 ntTSL 315.47■□□□□ 0.071e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 CAPZB-207ENST00000459967 579 ntTSL 315.43■□□□□ 0.061e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 EEF1G-203ENST00000525340 2496 ntTSL 1 (best)15.28■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 STK24-207ENST00000491878 547 ntTSL 414.49□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.111e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.111e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 MYO18B-203ENST00000418374 6363 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.361e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 MYO18B-207ENST00000539302 7774 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 PVT1-215ENST00000522963 568 ntTSL 411.6□□□□□ -0.551e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 PVT1-216ENST00000523068 844 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 C2orf88-201ENST00000340623 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 MYO18B-205ENST00000536101 8051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 EEF1G-202ENST00000524420 557 ntTSL 410.69□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 TXNL4A-209ENST00000589926 535 ntTSL 410.17□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 EXOC2-201ENST00000230449 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.81e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 PVT1-210ENST00000521122 221 ntTSL 39.77□□□□□ -0.851e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 NR2F2-AS1-207ENST00000560170 547 ntTSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.861e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 PVT1-207ENST00000518528 624 ntTSL 39.41□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 AP2M1-208ENST00000442686 673 ntTSL 29.39□□□□□ -0.911e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 AP2M1-218ENST00000480260 582 ntTSL 29.06□□□□□ -0.961e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 NR2F2-AS1-204ENST00000558935 482 ntTSL 38.22□□□□□ -1.091e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.211e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.221e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 ADGRV1-215ENST00000638990 2433 ntTSL 57.23□□□□□ -1.256e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 NR2F2-AS1-206ENST00000560010 468 ntTSL 27.09□□□□□ -1.271e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.291e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 C2orf88-203ENST00000409545 570 ntTSL 36.43□□□□□ -1.381e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 PVT1-205ENST00000517790 599 ntTSL 25.3□□□□□ -1.561e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 C2orf88-206ENST00000450357 486 ntTSL 34.07□□□□□ -1.761e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 C2orf88-208ENST00000490033 482 ntTSL 33.9□□□□□ -1.791e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 ENOSF1-215ENST00000583771 436 ntTSL 523.21■■□□□ 1.318e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 ENOSF1-218ENST00000584453 1230 ntTSL 523.18■■□□□ 1.38e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 ENOSF1-210ENST00000581332 451 ntTSL 420.55■□□□□ 0.888e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.648e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 ENOSF1-206ENST00000578651 1177 ntTSL 218.66■□□□□ 0.588e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 ENOSF1-211ENST00000581475 1745 ntTSL 1 (best)17.46■□□□□ 0.398e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.28e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.068e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 ENOSF1-222ENST00000585128 1296 ntTSL 513.64□□□□□ -0.238e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 ENOSF1-208ENST00000580605 699 ntTSL 313.19□□□□□ -0.38e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.488e-7■■■■□ 23.1
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 1697.5 ms