Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB3Q12988 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB3Q12988 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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