Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTN3Q08043 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms