Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms