Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA1P49639 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms