Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 CHCHD3-202ENST00000423635 1310 ntTSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.214e-12■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 CHCHD3-204ENST00000457942 559 ntTSL 415.87■□□□□ 0.134e-12■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 TNFRSF12A-203ENST00000571351 1678 ntTSL 221.82■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 TNFRSF12A-205ENST00000574699 583 ntTSL 219.7■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.882e-17■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.882e-17■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.422e-17■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 BOD1-204ENST00000471339 688 ntTSL 423.63■■□□□ 1.372e-17■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 AL365226.2-201ENST00000418403 397 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.799e-26■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 BAG5-204ENST00000557666 878 ntTSL 1 (best)22.48■■□□□ 1.197e-10■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.697e-10■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 TM2D1-211ENST00000496465 577 ntTSL 218.46■□□□□ 0.557e-18■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.427e-18■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.427e-18■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.427e-18■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 TM2D1-208ENST00000488206 921 ntTSL 516.48■□□□□ 0.237e-18■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 TM2D1-203ENST00000371178 1056 ntTSL 514.72□□□□□ -0.057e-18■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 TM2D1-210ENST00000494926 544 ntTSL 511.68□□□□□ -0.547e-18■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 TM2D1-202ENST00000371177 3218 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.557e-18■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 TM2D1-205ENST00000468586 637 ntTSL 38.49□□□□□ -1.057e-18■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 EMC4-204ENST00000557941 1201 ntTSL 216.64■□□□□ 0.251e-12■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 EMC4-205ENST00000558102 543 ntTSL 216.17■□□□□ 0.181e-12■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 EMC4-210ENST00000560911 579 ntTSL 215.76■□□□□ 0.111e-12■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.041e-12■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 EMC4-206ENST00000558205 1006 ntTSL 214.64□□□□□ -0.071e-12■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.071e-12■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.11e-12■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 EMC4-213ENST00000561372 466 ntTSL 313.86□□□□□ -0.191e-12■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.421e-12■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 EMC4-202ENST00000267750 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.981e-12■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.561e-7■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 RBMX-204ENST00000464781 1852 ntTSL 215.06■□□□□ 01e-64■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 RBMX-210ENST00000565907 563 ntTSL 214.74□□□□□ -0.051e-64■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.251e-64■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.271e-64■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 RBMX-211ENST00000567262 477 ntTSL 512.61□□□□□ -0.391e-64■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 RBMX-208ENST00000563370 577 ntTSL 312.61□□□□□ -0.391e-64■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 RBMX-212ENST00000568578 4887 ntTSL 1 (best)10.31□□□□□ -0.761e-64■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 RBMX-207ENST00000562646 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.791e-64■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.461e-64■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 LAMTOR2-206ENST00000489664 868 ntTSL 212.17□□□□□ -0.467e-11■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.477e-11■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 LAMTOR2-201ENST00000368302 587 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.67e-11■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 LAMTOR2-202ENST00000368304 521 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.77e-11■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ADPGK-205ENST00000562823 514 ntTSL 421.67■■□□□ 1.069e-7■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.99e-7■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ADPGK-213ENST00000569534 2262 ntTSL 220.46■□□□□ 0.879e-7■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ADPGK-211ENST00000569058 575 ntTSL 419.82■□□□□ 0.769e-7■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ADPGK-210ENST00000567941 2716 ntTSL 1 (best)17.95■□□□□ 0.469e-7■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ADPGK-212ENST00000569517 951 ntTSL 517.68■□□□□ 0.429e-7■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ADPGK-207ENST00000565814 795 ntTSL 58.23□□□□□ -1.099e-7■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.931e-12■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.481e-12■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ACAA1-212ENST00000460424 538 ntTSL 423.75■■□□□ 1.391e-12■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.291e-12■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ACAA1-218ENST00000489559 579 ntTSL 422.91■■□□□ 1.261e-12■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ACAA1-203ENST00000411549 1944 ntTSL 1 (best)21.82■■□□□ 1.081e-12■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ACAA1-207ENST00000440176 1328 ntTSL 221.79■■□□□ 1.081e-12■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ACAA1-206ENST00000423611 877 ntTSL 320.7■□□□□ 0.91e-12■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ACAA1-204ENST00000418880 737 ntTSL 320.42■□□□□ 0.861e-12■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.851e-12■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.81e-12■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ACAA1-217ENST00000484284 580 ntTSL 218.23■□□□□ 0.511e-12■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 ACAA1-208ENST00000447223 915 ntTSL 315.51■□□□□ 0.071e-12■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 TMEM219-209ENST00000602948 588 ntTSL 218.76■□□□□ 0.598e-8■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.153e-7■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 TMEM219-208ENST00000575829 721 ntTSL 514.6□□□□□ -0.078e-8■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.188e-8■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.837e-34■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.627e-34■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 INCENP-206ENST00000533896 570 ntTSL 416.3■□□□□ 0.23e-21■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 INCENP-203ENST00000528037 1372 ntTSL 1 (best)15.54■□□□□ 0.083e-21■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.093e-21■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.113e-21■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 GCOM1-204ENST00000463717 1694 ntTSL 221.98■■□□□ 1.111e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.921e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.891e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 GCOM1-211ENST00000496101 2032 ntTSL 1 (best)19.86■□□□□ 0.771e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 GCOM1-208ENST00000482814 1620 ntTSL 219.46■□□□□ 0.711e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.591e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.531e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 GCOM1-210ENST00000488175 2601 ntTSL 1 (best)17.85■□□□□ 0.451e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 POLR2M-208ENST00000567643 591 ntTSL 417.66■□□□□ 0.421e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 GCOM1-206ENST00000471563 2275 ntTSL 1 (best)16.28■□□□□ 0.21e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 GCOM1-212ENST00000496627 2500 ntTSL 216.05■□□□□ 0.161e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 GCOM1-205ENST00000468886 2508 ntTSL 1 (best)16.05■□□□□ 0.161e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 POLR2M-205ENST00000482852 2896 ntTSL 215.74■□□□□ 0.111e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 01e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 GCOM1-203ENST00000460962 3156 ntTSL 213.18□□□□□ -0.31e-13■■■■■ 33.4
Retrieved 100 of 47,714 protein–RNA pairs in 1577.5 ms