Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms