Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MAP1LC3B2A6NCE7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms