Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN7Q9Y6W3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN7Q9Y6W3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms