Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN8Q9UBY8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN8Q9UBY8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms