Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms