Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms