Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms