Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms