Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP43Q70EL4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms