Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM136Q6ZRR5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms