Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 FAAP20-211ENST00000469733 2280 ntTSL 218.11■□□□□ 0.492e-7■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 FAAP20-213ENST00000487186 3576 ntTSL 213.44□□□□□ -0.262e-7■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 CTSB-218ENST00000530624 430 ntTSL 516.05■□□□□ 0.167e-8■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.154e-8■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 SRRM2-211ENST00000572883 887 ntTSL 211.84□□□□□ -0.512e-17■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SMAP2-205ENST00000539317 2501 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.571e-7■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SMAP2-201ENST00000372708 2473 ntTSL 1 (best)9.71□□□□□ -0.851e-7■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SMAP2-206ENST00000614549 2570 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.861e-7■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 GSE1-215ENST00000635906 666 ntTSL 313.36□□□□□ -0.271e-6■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 CIZ1-214ENST00000474442 457 ntTSL 48.62□□□□□ -1.035e-8■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MICALL2-208ENST00000472100 5248 ntTSL 217.86■□□□□ 0.451e-6■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.161e-6■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.553e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.23e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.013e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 ILVBL-205ENST00000531635 947 ntTSL 321.22■□□□□ 0.993e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 ILVBL-208ENST00000533747 788 ntTSL 221.15■□□□□ 0.983e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 ILVBL-204ENST00000527093 1090 ntTSL 1 (best)21.15■□□□□ 0.983e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.733e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 ILVBL-207ENST00000533148 1309 ntTSL 519.25■□□□□ 0.673e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 ILVBL-214ENST00000600984 709 ntTSL 319.14■□□□□ 0.653e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.618e-21■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.533e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.433e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.353e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 ILVBL-212ENST00000598709 747 ntTSL 516.8■□□□□ 0.283e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 ILVBL-213ENST00000599324 568 ntTSL 1 (best)16.49■□□□□ 0.233e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MYL6-216ENST00000550184 1564 ntTSL 516.24■□□□□ 0.198e-21■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.13e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.033e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.023e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.048e-21■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.128e-21■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.148e-21■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MROH1-205ENST00000527552 5832 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.343e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MROH1-208ENST00000532255 3905 ntTSL 211.54□□□□□ -0.563e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MYL6-206ENST00000547408 683 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.738e-21■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MYL6-205ENST00000546845 452 ntTSL 310.14□□□□□ -0.798e-21■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MYL6-207ENST00000547649 655 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.858e-21■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MYL6-201ENST00000293422 664 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.968e-21■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.118e-21■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.398e-21■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.411e-7■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 NCOR2-219ENST00000474079 321 ntTSL 219.35■□□□□ 0.692e-19■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SLC7A5-202ENST00000563489 780 ntTSL 217.21■□□□□ 0.352e-37■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 NCOR2-211ENST00000443451 951 ntTSL 516.34■□□□□ 0.212e-19■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 NCOR2-216ENST00000461081 2910 ntTSL 215.71■□□□□ 0.112e-19■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SQSTM1-206ENST00000466342 808 ntTSL 213.12□□□□□ -0.313e-8■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.751e-7■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.241e-7■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.711e-7■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.51e-7■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.121e-7■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.516e-8■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.436e-8■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SSH2-205ENST00000577483 1630 ntTSL 1 (best)14.06□□□□□ -0.166e-8■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SSH2-207ENST00000578411 633 ntTSL 213.27□□□□□ -0.296e-8■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SSH2-208ENST00000579040 965 ntTSL 1 (best)12.88□□□□□ -0.356e-8■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SSH2-209ENST00000579954 428 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.816e-8■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.416e-8■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.436e-8■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 TUBA1B-203ENST00000547476 584 ntTSL 412.96□□□□□ -0.334e-13■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 TUBA1B-208ENST00000552984 574 ntTSL 412.72□□□□□ -0.374e-13■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 TUBA1B-207ENST00000551324 840 ntTSL 210.61□□□□□ -0.714e-13■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 CHTF18-216ENST00000565787 607 ntTSL 526.28■■□□□ 1.87e-16■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 CHTF18-204ENST00000440239 1801 ntTSL 1 (best)25.37■■□□□ 1.657e-16■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 CHTF18-218ENST00000569270 711 ntTSL 521.49■■□□□ 1.037e-16■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 CHTF18-203ENST00000426047 790 ntTSL 317.96■□□□□ 0.477e-16■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.377e-16■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 CHTF18-211ENST00000491530 819 ntTSL 516.94■□□□□ 0.37e-16■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.277e-16■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 CHTF18-217ENST00000567620 701 ntTSL 516.57■□□□□ 0.247e-16■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.157e-16■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 CHTF18-207ENST00000464728 4088 ntTSL 215.01□□□□□ -0.017e-16■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 214.71□□□□□ -0.067e-16■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.197e-16■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 TLK1-201ENST00000359766 4321 ntTSL 511.32□□□□□ -0.64e-9■■■□□ 18.8
PCBP1Q15365 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.168e-7■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 SLC2A4RG-207ENST00000493772 1328 ntTSL 1 (best)22.02■■□□□ 1.124e-6■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 SLC2A4RG-202ENST00000473157 991 ntTSL 319.1■□□□□ 0.654e-6■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 UBE2D2-204ENST00000505007 1170 ntTSL 321.29■■□□□ 12e-7■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.452e-7■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 UBE2D2-208ENST00000511725 656 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.582e-7■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 UBE2D2-206ENST00000510470 256 ntTSL 28.7□□□□□ -1.022e-32■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 UBE2D2-203ENST00000398734 901 ntTSL 57.96□□□□□ -1.142e-7■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 PPDPF-203ENST00000464438 373 ntTSL 220.69■□□□□ 0.91e-323■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.072e-8■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-8■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 BAG6-258ENST00000464126 609 ntTSL 216.41■□□□□ 0.227e-8■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 BAG6-244ENST00000435080 1710 ntTSL 515.88■□□□□ 0.132e-11■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 ATP11A-206ENST00000419631 2446 ntTSL 313.67□□□□□ -0.222e-12■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 ATP11A-210ENST00000471555 5786 ntTSL 1 (best)11.38□□□□□ -0.592e-12■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 ATP11A-217ENST00000614170 3542 nt10.19□□□□□ -0.782e-12■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 RPLP1-205ENST00000560274 256 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.962e-26■■■□□ 18.6
PCBP1Q15365 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.823e-9■■■□□ 18.6
PCBP1Q15365 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.263e-9■■■□□ 18.6
PCBP1Q15365 ARF5-204ENST00000463733 1509 ntTSL 519.25■□□□□ 0.672e-6■■■□□ 18.6
PCBP1Q15365 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-6■■■□□ 18.6
PCBP1Q15365 CLTC-213ENST00000584313 715 ntTSL 315.95■□□□□ 0.145e-41■■■□□ 18.6
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