Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCF4Q15080 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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