Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
ODF1Q14990 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ODF1Q14990 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms