Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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