Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC159P0C7I6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC159P0C7I6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms