Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms