Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.174e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.135e-14■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 PMP22-208ENST00000580584 428 ntTSL 315.86■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 GALNS-209ENST00000567525 1953 ntTSL 215.76■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.032e-9■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 MRPS34-203ENST00000569585 713 ntTSL 215.14■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 TFE3-204ENST00000493583 3279 ntTSL 214.99□□□□□ -0.016e-15■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.035e-14■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CTSA-211ENST00000606066 603 ntTSL 514.87□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CTSA-219ENST00000607841 571 ntTSL 214.87□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CTSA-216ENST00000607212 590 ntTSL 414.79□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 ZNF75A-206ENST00000575234 3989 nt14.75□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 HOXC9-202ENST00000504557 581 ntTSL 314.59□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.147e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 EDRF1-209ENST00000525091 4211 ntTSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 HOXC6-203ENST00000504315 538 ntTSL 313.96□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CTSA-218ENST00000607814 584 ntTSL 413.96□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.216e-9■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 GALNS-212ENST00000568613 1804 ntTSL 213.43□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CTSA-212ENST00000606394 584 ntTSL 413.27□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 FAM84A-202ENST00000331243 3765 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.313e-31■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 EDRF1-208ENST00000481600 4181 ntTSL 212.45□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 FAM117A-204ENST00000503855 582 ntTSL 312.32□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CNOT3-202ENST00000358389 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.485e-14■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 EDRF1-206ENST00000419769 4243 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 REXO5-213ENST00000567297 753 ntTSL 311.66□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SCARB2-222ENST00000640634 1734 ntTSL 511.48□□□□□ -0.575e-14■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 EDRF1-205ENST00000368815 4123 ntTSL 1 (best)11.38□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 EDRF1-202ENST00000356792 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 33.6
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DDX3XO00571 ZNF75A-202ENST00000571101 598 ntTSL 410.82□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 HTD2-204ENST00000476007 847 ntTSL 210.47□□□□□ -0.731e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 MT1E-203ENST00000568293 332 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.773e-31■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SCARB2-204ENST00000509994 545 ntTSL 410.18□□□□□ -0.785e-14■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SLC9B2-204ENST00000503230 1826 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 PDPR-201ENST00000288050 9255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.815e-14■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 RPP14-205ENST00000463550 658 ntTSL 1 (best)9.94□□□□□ -0.821e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LINC00630-204ENST00000435966 568 ntTSL 39.7□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 33.6
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DDX3XO00571 LINC00630-202ENST00000420471 838 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LINC00630-203ENST00000431616 561 ntTSL 59.03□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 FAM117A-203ENST00000503720 528 ntTSL 48.89□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.995e-14■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.055e-14■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 AEBP2-207ENST00000541908 975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.072e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.172e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SCARB2-226ENST00000640916 689 ntTSL 27.61□□□□□ -1.195e-14■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 AEBP2-206ENST00000538425 518 ntAPPRIS ALT2 TSL 47.38□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SCARB2-218ENST00000639715 4355 ntTSL 55.91□□□□□ -1.465e-14■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 KIAA0232-204ENST00000503278 563 ntTSL 45.83□□□□□ -1.482e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SLC9B2-208ENST00000508136 578 ntTSL 35.4□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 SLC9B2-205ENST00000503818 648 ntTSL 45.22□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.185e-11■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.935e-11■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.53e-9■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 C22orf39-204ENST00000509549 2979 ntTSL 213.02□□□□□ -0.338e-9■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LRRC61-203ENST00000463441 667 ntTSL 224.71■■□□□ 1.555e-21■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.623e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.573e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.573e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.53e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.43e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.393e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 LSR-207ENST00000597933 873 ntTSL 515.94■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 PCGF5-203ENST00000496708 811 ntTSL 521.91■■□□□ 1.13e-12■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.413e-12■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.473e-12■■■■■ 33.6
DDX3XO00571 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.434e-12■■■■■ 33.5
DDX3XO00571 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.394e-12■■■■■ 33.5
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