Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
J3KR12 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
J3KR12 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
J3KR12 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
J3KR12 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KR12 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KR12 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KR12 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KR12 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KR12 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KR12 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KR12 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KR12 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KR12 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KR12 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KR12 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KR12 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KR12 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KR12 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KR12 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KR12 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KR12 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KR12 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms